Não mô cầu và cúm đều có triệu chứng sốt cao trong một đến hai ngày đầu, kèm đau đầu, đau họng và đau nhức mỏi người.
Điểm khác biệt là sốt ở não mô cầu thường đột ngột, không đáp ứng với thuốc hạ sốt. Lý do, khi vi khuẩn não mô cầu xâm nhập vào cơ thể qua đường hô hấp, đến máu, hệ thần kinh sẽ gây ra triệu chứng sốt, gây viêm ở mọi nơi trên cơ thể người bệnh. Lúc này, người bệnh ngoài sốt còn gặp thêm các triệu chứng như buồn nôn, cứng cổ, sợ ánh sáng, xuất hiện tử ban màu đỏ hoặc tím rải rác hoặc thành từng mảng.
