Có nhiều nguyên nhân gây viêm họng nhưng phổ biến nhất là do virus cảm hoặc cúm, một số trường hợp có thể do trào ngược dạ dày. Viêm họng do trào ngược có xu hướng kéo dài trên 10 ngày.
Trào ngược dạ dày xảy ra khi acid, pepsin (men tiêu hóa được sản xuất từ dạ dày), đôi khi có cả dịch mật đi từ dạ dày ngược lên thực quản và đến họng. Niêm mạc họng vốn mỏng, nhạy cảm, không có cơ chế bảo vệ trước acid nên dễ tổn thương. Acid, pepsin tiếp xúc với niêm mạc họng trong thời gian dài sẽ phá vỡ lớp bảo vệ tự nhiên, gây viêm, phù nề, kích thích dây thần kinh cảm giác.
