Nhiệt miệng tái phát liên tục khiến nhiều người cho rằng nguyên nhân là do thiếu vitamin. Điều này chưa hẳn đúng. Đến nay, nguyên nhân của nhiệt miệng chưa được biết rõ, có thể do sự phối hợp của gen, yếu tố môi trường và yếu tố miễn dịch.
Một số yếu tố nguy cơ dẫn đến tình trạng nhiệt miệng là do thiếu các yếu tố vi lượng: Sắt, folate, vitamin B1, B2, B6, B12, kẽm.
