Tai mũi họng là hệ thống thông nhau nên khi viêm xoang tái phát, dịch mủ từ xoang chảy xuống họng kích thích niêm mạc họng, amidan, làm trầm trọng thêm triệu chứng. Ngược lại, amidan viêm thường xuyên cũng là ổ nhiễm trùng ảnh hưởng lên xoang, tạo điều kiện cho viêm nhiễm họng - mũi kéo dài.
Viêm xoang mạn tính thường kéo dài trên ba tháng, làm thay đổi cấu trúc giải phẫu trong xoang. Lúc này, các lỗ thông xoang bị bít tắc, dịch không thể dẫn lưu ra ngoài, đồng thời niêm mạc xoang bắt đầu phù nề và thoái hóa, hình thành polyp.
