Tại Vinmec, ông tiếp tục theo đuổi mục tiêu bồi dưỡng thế hệ phẫu thuật viên kế cận, phát triển năng lực phẫu thuật nhi chuyên sâu, đưa những thành tựu chuyên môn đến với nhiều trẻ em hơn, để các em có thêm cơ hội được điều trị bằng các phương pháp nhẹ nhàng hơn.
Năm 2016, để triển khai nội soi một lỗ điều trị thoát vị bẹn ở trẻ em, PGS.TS.BS Trần Ngọc Sơn phải đối mặt một thách thức lớn: kim khâu chuyên dụng chưa sẵn có tại Việt Nam. Thay vì buông xuôi hay chờ đợi, ông tìm cách cải tiến kim chọc tủy sống, biến dụng cụ vốn dành cho một mục đích thành giải pháp phục vụ phẫu thuật nội soi nhi. Sáng kiến này còn giúp tiết kiệm chi phí dụng cụ, góp phần giảm gánh nặng tài chính cho gia đình bệnh nhi.
