Ban Chỉ đạo có Chủ tịch UBND Thành phố là Trưởng ban. Các Phó Trưởng ban là Phó Chủ tịch Thường trực HĐND Thành phố, Trưởng ban Ban Tuyên giáo Thành ủy, Trưởng ban Ban Dân vận Thành ủy, Phó Chủ tịch Thường trực Ủy ban Mặt trận Tổ quốc Việt Nam Thành phố và các Phó Chủ tịch UBND Thành phố là Phó Trưởng ban Thường trực các lĩnh vực được phụ trách. Các thành viên còn lại là người đứng đầu các sở ngành, Chủ tịch UBND thành phố Thủ Đức và các quận huyện có dự án trọng điểm.
Về quyền hạn, Ban Chỉ đạo sẽ chỉ đạo, kiểm tra, đôn đốc chủ đầu tư công trình, dự án, các tổ chức tư vấn, nhà thầu trong thực hiện nhiệm vụ đảm bảo tiến độ, chất lượng công trình; đề xuất mời cơ quan thanh tra, kiểm toán thực hiện kiểm tra đột xuất, định kỳ các công trình, dự án khi thấy cần thiết để phòng ngừa từ xa, từ sớm các sai sót (nếu có).
