Thạch Yên sinh ra trong một ngôi làng thuộc tỉnh Hà Bắc, Trung Quốc. Nhà nghèo nên cô luôn ý thức được chỉ có con đường học hành mới có thể thay đổi được cuộc sống hiện tại. Sau khi tốt nghiệp cấp 3, cô thi đỗ vào Đại học Nông nghiệp Hà Bắc với chuyên ngành Nông nghiệp yêu thích.
Theo chia sẻ của cô, sự lựa chọn này có nguồn gốc từ trải nghiệm thời thơ ấu của Thạch Yên. Khi còn nhỏ, cô đã đến vùng nông thôn để trải nghiệm cuộc sống với cha mẹ. Họ đều là nhân viên tại các trang trại lớn. Đó là cơ duyên giúp cô nhận ra đam mê nông nghiệp của mình.
