Trong đó, Tổ 1 do ông Nguyễn Khắc Toàn, Chủ tịch UBND tỉnh Khánh Hòa làm tổ trưởng, phụ trách khu vực TP.Nha Trang và đặc khu Trường Sa để ứng phó bão Kalmaegi; Tổ 2 do ông Nguyễn Long Biên, Phó chủ tịch Thường trực UBND tỉnh, phụ trách khu vực Phan Rang - Ninh Phước; Tổ 3 do ông Trần Hòa Nam, Phó chủ tịch UBND tỉnh, phụ trách khu vực Diên Khánh - Khánh Vĩnh.
Các tổ còn lại do các Phó chủ tịch UBND tỉnh, lãnh đạo Bộ Chỉ huy Quân sự, Công an tỉnh và Sở NN-MT làm tổ trưởng, phụ trách những địa bàn còn lại của tỉnh. Các tổ công tác có nhiệm vụ trực tiếp kiểm tra, giám sát phương án ứng phó tại cơ sở; chỉ đạo sơ tán dân, bảo vệ hồ đập, công trình giao thông, kiểm soát tàu thuyền, bảo đảm an toàn cho học sinh, khách du lịch và hoạt động sản xuất.
