Một trong những tác dụng phụ phổ biến của trà sữa là gián đoạn chu kỳ ngủ do chứa caffeine. Những người sử dụng đồ uống này gần giờ đi ngủ thường tỉnh táo, dễ thức dậy trong đêm. Tình trạng này có thể dẫn đến mệt mỏi vào ban ngày, suy giảm chức năng nhận thức, chất lượng cuộc sống. Những người nhạy cảm với caffeine nên hạn chế nạp đồ uống này vào buổi tối.
Trà sữa cung cấp năng lượng cho người uống nhưng dễ làm tăng lượng đường trong máu. Người có chế độ ăn uống không lành mạnh, dùng nhiều đồ ngọt, ít tập thể dục dễ thừa cân, béo phì.
