Khi biết vụ việc đã bị cơ quan Công an phát hiện, các bác sĩ, cán bộ có liên quan đã làm giả hồ sơ, viết rằng " bệnh nhân bắt buộc chữa bệnh hành hung nhân viên y tế rồi bỏ trốn" để hợp thức hồ sơ báo cáo các cơ quan chức năng.
Xác định vụ việc có dấu hiệu phạm tội, Công an TP Hà Nội đã giao Cơ quan An ninh điều tra tiến hành xác minh làm rõ.
Căn cứ kết quả điều tra, ngày 17/6, Cơ quan An ninh điều tra đã ra Quyết định khởi tố bị can, Lệnh bắt bị can để tạm giam, Lệnh khám xét đối với ông Hà Huy Dũng (SN 1970), Trưởng khoa Điều trị bắt buộc - Bệnh viện Tâm thần Trung ương I về tội nhận hối lộ theo Điều 354 Bộ luật Hình sự.
Sau khi được Viện Kiểm sát nhân dân TP Hà Nội phê chuẩn, Cơ quan An ninh điều tra – Công an TP Hà Nội đã tổ chức thi hành các quyết định, lệnh trên.
Quá trình điều tra bước đầu xác định, ông Hà Huy Dũng - người có trách nhiệm điều trị, quản lý các bệnh nhân - đã lợi dụng chức vụ, quyền hạn nhận tiền của gia đình và bệnh nhân bắt buộc chữa bệnh để làm trái các quy định về quản lý, chữa bệnh đối với bệnh nhân bắt buộc chữa bệnh.
Hiện vụ án đang được Cơ quan An ninh điều tra – Công an TP Hà Nội tiếp tục điều tra mở rộng để xử lý theo quy định.