Sau khoảng 2 năm thông xe, các phương tiện được lưu thông miễn phí, từ 22h đêm 2/3 xe ô tô lưu thông trên 5 tuyến cao tốc Bắc Nam phía Đông từ Ninh Bình vào các tỉnh phía Nam phải trả phí qua các trạm thu phí được bố trí ở các điểm ra vào.
5 dự án này bao gồm các đoạn tuyến: Mai Sơn - Quốc lộ 45, Quốc lộ 45 - Nghi Sơn, Nghi Sơn - Diễn Châu, Vĩnh Hảo - Phan Thiết và Phan Thiết - Dầu Giây.
Khác với các trạm thu phí trên các tuyến cao tốc, QL Bắc Nam hiện nay (phải có trạm, thanh chắn barie...), hệ thống thu phí được áp dụng tại 5 đoạn tuyến cao tốc áp dụng công hiện đại không cần trạm, thanh barie...
Tất cả xe ô tô qua trạm được hệ thống nhận diện qua sóng RFID và camera từ trên cao. Đây là công nghệ được đánh giá là nhận diện biển số để tự động và trừ tiền trong tài khoản chủ xe nhanh chóng, linh hoạt nhất.
Để giúp xe qua trạm an toàn, dễ dàng nhận diện, Cục Cảnh sát giao thông (CSGT) cũng đồng ý để tốc độ xe ô tô qua trạm là từ 30 đến 50km/h (trong tuyến được lưu thông cao nhất 90km/h).
Ngoài ra, trạm còn có hệ thống kiểm soát tải trọng xe tự động được lắp đặt ngầm ở lòng đường, sẵn sàng nhận diện, ngăn chặn xe chở quá tải đi vào, phá hỏng mặt đường cao tốc.
Để các trạm thu phí sử dụng được công nghệ kiểm soát, ngăn chặn xe quá tải đi vào cao tốc, những ngày qua các đơn vị quản lý trạm đã thi công ở các nút giao có trạm thu phí thêm một làn đường xe quay đầu. Cao tốc Bắc Nam phía Đông là tuyến cao tốc thứ hai tại Việt Nam (sau cao tốc Hà Nội - Hải Phòng) áp dụng công nghệ kiểm soát xe quá tải tự động.
Như vậy, cùng với nộp phí, từ đêm qua (2/3) xe ô tô, trong đó có xe tải nếu đi vào cao tốc Bắc Nam phía Đông nếu chở quá tải xe bị từ chối phục vụ, bị cơ quan chức năng xử lý và buộc quay đầu ra khỏi cao tốc.
