Cà phê chứa polyphenol và tannin làm giảm khả năng hấp thụ sắt từ 35% đến hơn 60%, nên cần uống cách nhau từ 1 đến 2 giờ.
Các hợp chất trong cà phê cũng liên kết với kẽm tại ruột non tạo thành hợp chất không hòa tan, đòi hỏi quy tắc giãn cách tương tự.
Caffeine có tác dụng lợi tiểu làm tăng đào thải canxi qua thận, mỗi ly cà phê có thể lấy đi khoảng 5 miligam canxi.
Uống cà phê gần thời điểm bổ sung magiê dễ gây đào thải khoáng chất và kích thích đường ruột dẫn đến tiêu chảy hoặc chuột rút.
Hàm lượng caffeine cao làm tăng nguy cơ thiếu hụt các vitamin nhóm B như B1, B6 và B12 do thúc đẩy quá trình bài tiết qua nước tiểu.
Theo báo cáo từ Hiệp hội Cà phê Quốc gia Hoa Kỳ (NCA), khoảng 66% người trưởng thành ở Mỹ uống cà phê hàng ngày. Còn theo kết quả khảo sát người tiêu dùng của Hội đồng Dinh dưỡng Có trách nhiệm (CRN), có đúng 74% người trưởng thành tại Mỹ sử dụng các loại thực phẩm bổ sung sức khỏe (như vitamin, khoáng chất, thực phẩm chức năng).
Ở các quốc gia, khu vực khác của thế giới hiện đại, cà phê và thực phẩm chức năng cũng ngày càng có mặt nhiều hơn trong cuộc sống thường ngày của người dân.
