Liên quan vướng mắc tại Nghị định 46 và Nghị quyết 66.13 của Chính phủ, trong Công văn số 18 gửi Phó thủ tướng lê Thành Long, Hiệp hội sữa Việt Nam cho biết, hiện nay toàn bộ các lô hàng thực phẩm nhập khẩu, bao gồm cả thành phẩm và nguyên liệu dùng để sản xuất, đang kẹt tại cảng, không thể thông quan do việc kiểm tra nhà nước đã được chuyển về UBND các tỉnh thành phố từ ngày 27.1 theo Nghị định 46. Thế nhưng, UBND các tỉnh thành chưa có bất kỳ một hướng dẫn nào, nên các cơ quan kiểm tra nhà nước không thể lấy mẫu kiểm tra và cấp giấy xác nhận đạt chất lượng nhập khẩu. Từ đó, cơ quan hải quan không có cơ sở để cho thông quan.
Ngoài ra, Hiệp hội sữa Việt Nam cho biết, thủ tục kiểm tra hàng hóa nhà nước nhập khẩu, thay vì 1 bước (cơ quan nhà nước kiểm tra và cấp ngay nếu đạt), nay tăng thành 3 bước gồm cơ quan có thẩm quyền cấp tỉnh quyết định kiểm tra như thế nào và đi lấy mẫu; xong chuyển mẫu cho cơ quan kiểm tra nhà nước được chỉ định và kiểm tra; kết quả được gửi về cơ quan có thẩm quyền cấp tỉnh để cấp giấy xác nhận đạt chất lượng nhập khẩu.
