Theo Cục Hải quan, trong quá trình triển khai Nghị định 46 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành một số điều và biện pháp để tổ chức, hướng dẫn thi hành luật An toàn thực phẩm và Nghị quyết số 66.13/2026 ngày 27.1 của Chính phủ quy định về công bố, đăng ký sản phẩm thực phẩm, Cục Hải quan nhận được một số phản ánh vướng mắc của các chi cục hải quan khu vực và doanh nghiệp.
Cụ thể, tại các cửa khẩu diễn ra tình trạng các đơn vị thực hiện kiểm tra nhà nước về an toàn thực phẩm theo quy định tại Nghị định số 46 tạm ngưng cấp giấy chứng nhận kiểm dịch và kiểm tra an toàn thực phẩm cho các lô hàng thực phẩm nhập khẩu có nguồn gốc từ thực vật và động vật. Lý do: mặc dù Nghị định 46 và Nghị quyết 66.13 đều có quy định chuyển tiếp đối với "việc tự công bố và đăng ký bản công bố sản phẩm, cơ quan kiểm tra nhà nước đối với thực phẩm nhập khẩu", tuy nhiên không có điều khoản chuyển tiếp đối với trình tự kiểm tra nhà nước về an toàn thực phẩm với thực phẩm nhập khẩu. Đây là cơ sở để các cơ quan quản lý chuyên ngành ban hành thông báo kết quả xác nhận thực phẩm đạt yêu cầu nhập khẩu.
