Cho rằng nhóm hộ kinh doanh nhỏ và siêu nhỏ đang gặp nhiều khó khăn trong việc triển khai quy định về hóa đơn, chứng từ và dẫn cả khảo sát của Liên đoàn Thương mại và Công nghiệp VN (VCCI), Hiệp hội Ngân hàng VN kiến nghị Chính phủ nên có văn bản chính thức, khẳng định không truy thu thuế đối với giai đoạn trước khi chuyển đổi thuế khoán sang thuế tính trên doanh thu. Bên cạnh đó, cần thiết lập giai đoạn chuyển tiếp tối thiểu một năm, trong đó không xử phạt đối với các lỗi kê khai hóa đơn điện tử; áp dụng chính sách miễn, giảm thuế trong 1-2 năm đầu để hộ kinh doanh thích ứng dần; xây dựng hệ thống sổ sách, chứng từ đơn giản, dễ thực hiện, phù hợp với quy mô nhỏ… Việc triển khai áp dụng cũng cần thực hiện theo lộ trình, ưu tiên các hộ lớn tại đô thị, sau đó mới mở rộng sang hộ nhỏ ở nông thôn; tăng cường truyền thông, tập huấn, đào tạo để nâng cao nhận thức và kỹ năng sử dụng hóa đơn điện tử; hỗ trợ cung cấp phần mềm, hóa đơn miễn phí và thiết lập đường dây nóng trợ giúp trong giai đoạn đầu…
Từ ngày 1.1.2026, hình thức thuế khoán áp dụng với hộ kinh doanh sẽ bị xóa bỏ theo Nghị quyết 68 của Bộ Chính trị
