Quy trình nhìn chung gồm: đăng nhập cổng dịch vụ công ngành thuế; lựa chọn hình thức đăng nhập; chọn đối tượng "Doanh nghiệp"; nhập thông tin đăng nhập; chọn thủ tục hành chính mã 1.008309; lựa chọn tờ khai quyết toán 05/QTT-TNCN; chọn hình thức kê khai trực tuyến; khai thông tin chung; cập nhật thông tin tổng số lao động.
Sau đó là kê khai danh sách người lao động; kê khai người phụ thuộc giảm trừ gia cảnh; kê khai bảng kê cá nhân tính thuế theo thuế suất toàn phần; kiểm tra thông tin tờ khai; tra cứu hồ sơ lưu tạm; nộp hồ sơ khi trạng thái "Đạt". Cuối cùng là ký số và hoàn thành nộp tờ khai.
