Trong quá trình triển khai thực hiện tại địa phương, phát sinh vướng mắc liên quan đến việc áp dụng quy định về đóng BHXH bắt buộc đối với Trưởng thôn và các chức danh hoạt động không chuyên trách ở thôn. Đặc biệt, cụm từ: "Mức phụ cấp hằng tháng bao gồm cả hỗ trợ đóng bảo hiểm xã hội" được quy định trong nghị quyết của HĐND tỉnh hiện đang được hiểu và áp dụng theo nhiều cách khác nhau.
Việc chưa có hướng dẫn thống nhất dẫn đến sự khác biệt trong tổ chức thực hiện giữa các địa phương, ảnh hưởng đến việc xác định quyền, nghĩa vụ và phương thức thực hiện chế độ BHXH đối với người hoạt động không chuyên trách ở thôn.
