Trong mạng lưới hàng không nội địa, chặng bay đến Côn Đảo được xem là đường bay ngoại lệ đặc biệt. Dù thời gian bay ngắn nhưng đây được xem là hành trình đầy thách thức, đòi hỏi phi công phải tập trung cao độ khi hạ cánh tại đây.
Sự “khó nhằn” này xuất phát từ địa hình đặc biệt của Côn Đảo. Đặc biệt nhất, cảng hàng không Côn Đảo có cơ sở hạ tầng khá hạn chế, đường bay chỉ dài khoảng 1800m và chưa bằng một nửa đường bay của sân bay Tân Sơn Nhất hay Nội Bài. Chính vì lý do khá đặc thù nên sân bay Côn Đảo chưa tiếp nhận được các loại tàu bay lớn như A320/A321, mà chỉ tiếp nhận được các loại tàu bay như ATR72, Embraer E190.
